రోజువారీ ఆహారంలో పుట్టగొడుగులు ఆరోగ్యకరమైనవి అయినప్పటికీ, ఎక్కువ తినడం వల్ల కడుపు నొప్పి, వికారం, వాంతులు, విరేచనాలు, గ్యాస్ట్రిక్, కడుపు నొప్పి లాంటి సమస్యలు రావచ్చట. పుట్టగొడుగుల్లో చిటిన్, మన్నిటాల్, ట్రెహలోస్ వంటి కార్బోహైడ్రేట్లు ఉంటాయి. ఇవి జీర్ణం కావడం కష్టం.